rhel怎么安装OF

shrine

网上搜了下，第一步源就搞不定，有没有现成的，抄个作业

shrine

@shrine 先下载了mpich，安装了一两个小时才好，到了./Allwmake 时出现致命错误，缺少scotch.h

李东岳

@shrine rhel有没有openmpi？

shrine

@李东岳应该是没有，设置环境变量时


gcc: error: unrecognized command line option ‘--showme:link’

系统自带的gcc版本不够？

 gcc -v
Using built-in specs.
COLLECT_GCC=gcc
COLLECT_LTO_WRAPPER=/usr/libexec/gcc/x86_64-redhat-linux/4.8.5/lto-wrapper
Target: x86_64-redhat-linux
Configured with: ../configure --prefix=/usr --mandir=/usr/share/man --infodir=/usr/share/info --with-bugurl=http://bugzilla.redhat.com/bugzilla --enable-bootstrap --enable-shared --enable-threads=posix --enable-checking=release --with-system-zlib --enable-__cxa_atexit --disable-libunwind-exceptions --enable-gnu-unique-object --enable-linker-build-id --with-linker-hash-style=gnu --enable-languages=c,c++,objc,obj-c++,java,fortran,ada,go,lto --enable-plugin --enable-initfini-array --disable-libgcj --with-isl=/builddir/build/BUILD/gcc-4.8.5-20150702/obj-x86_64-redhat-linux/isl-install --with-cloog=/builddir/build/BUILD/gcc-4.8.5-20150702/obj-x86_64-redhat-linux/cloog-install --enable-gnu-indirect-function --with-tune=generic --with-arch_32=x86-64 --build=x86_64-redhat-linux
Thread model: posix
gcc version 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-28) (GCC)

李东岳

嗯要装一下高版本的应该就没问题了

shrine

@李东岳我想放弃了，要装的东西太多了，关键一个个手动编译还有版本依赖。可不可以直接放到docker里运行

bestucan

可以搜搜 devtoolset。红帽系的低版本系统使用高版本开发工具的包

李东岳

@shrine 不清楚，我这面用ubuntu就没换过，我学生用centOS问题也不大，其他的暂时没玩过

shrine

@bestucan 原本想用docker，也是不熟悉，没弄起来

现在原生环境下thirdparty和of都./Allwmake成功了，但是blockmesh显示GLIBC_2.23' not found，不知道是不是哪里没装好

网上说升级这个GLIBC库挺危险的，我configure就没成功，
configure:5337: result: python3
configure:5352: checking version of python3
configure:5362: result: 3.7.11, ok
configure:5372: error:
*** These critical programs are missing or too old: make
*** Check the INSTALL file for required versions.

xpqiu

@shrine

看上面的帖子，你的 RHEL 系统自带gcc 是 4.8.5，所以肯定是 RHEL 7 。RHEL 7的 glibc 最高支持应该是到 GLIBC_2.17。所以你运行 blockMesh 提示 GLIBC_2.23 not found，我大胆猜测应该是你从网上下载了某个别的软件（二进制的），这个软件是在一个比 RHEL 新的电脑上编译的，然后你可能设置了 LD_LIBRARY_PATH，把这个软件的 lib 目录添加了进去，然后这个软件的 lib 里面有个.so库，跟 blockMesh 需要的某个 .so 同名。于是 blockMesh 运行的时候，就去链接那个软件里面的库了（而不是你编译 blockMesh 的时候链接的那个），同时那个软件的库最低要求 GLIBC_2.23，这个是你当前系统无法满足的，所以就有了这个报错。

排查方法：
运行如下命令

ldd  $(which blockMesh)

看 blockMesh 实际链接的是那些库，然后看看有没有异常。

shrine

@xpqiu 运行结果是

/home/xry/OpenFOAM-8/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/blockMesh: /lib64/libm.so.6: version `GLIBC_2.29' not found (required by /home/xry/OpenFOAM-8/platforms/linux64GccDPInt32Opt/lib/libOpenFOAM.so)
/home/xry/OpenFOAM-8/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/blockMesh: /lib64/libm.so.6: version `GLIBC_2.23' not found (required by /home/xry/OpenFOAM-8/platforms/linux64GccDPInt32Opt/lib/libOpenFOAM.so)

我安装完GCC11已经软链了
ln -sf /usr/local/gcc/lib64/libstdc++.so.6.0.22 /usr/lib64/libstdc++.so.6（6.0.22已经改成了29）

shrine

@xpqiu 不知道是不是安装gcc11惹的祸

我开始直接安装mpich，source的时候会出现三楼的错误，所以我怀疑时gcc版本不够，升级到11，其实source还是出现同样的错误，但我没管，仍然./Allwmake
居然成功了，后来再source就没再出现同样的错误，真tm神奇

xpqiu

@shrine
你的 gcc11 是如何安装的呢，我估计不是自己下载源码编译出来的吧？应该是下载的某个 rpm 包之类的来安装的吧？如果是的话，那么你系统里面凡是依赖 libstdc++.so.6 这个库的程序，应该都不能正常运行了，因为你这个 ln -sf 操作，把系统默认的 libstdc++.so.6 给改了。

三楼那个错误，不是 gcc 版本的问题，是mpi 没配置好的问题。你可以把 rhel 7 的源换成 centos 7 的，这样就可以直接rpm 安装openmpi。

shrine

@xpqiu 不是rpm包，是自己编译。

现在不管了，交给运维了，1000块，自己瞎搞，把同事的监测搞没了，被骂了一顿...

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