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  2. OpenFOAM
  3. OpenFOAM在并行运算结束后 能否并行reconstructPar?或者有没有其他方法能够加快reconstructPar?

OpenFOAM在并行运算结束后 能否并行reconstructPar?或者有没有其他方法能够加快reconstructPar?

已定时 已固定 已锁定 已移动 OpenFOAM
21 帖子 9 发布者 17.3k 浏览
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  • S 离线
    S 离线
    Stan同学
    写于 最后由 编辑
    #1

    最近跑了几个网格总数比较大的案例(大概500w~1000w),并行计算结束后,执行了reconstructPar进行重构,但是重构时间特别长。

    想请问各位老师,进行重构时能否像运算时那样并行呢?或者有没有其他方法可以加快重构的速度呢?
    (听同学说可以给服务器指定一部分线程用于重构某一部分,再指定另外一部分线程去重构另一部分,请问这种办法能够实现吗?)

    :chouchou:

    1 条回复 最后回复
  • 李东岳李 离线
    李东岳李 离线
    李东岳 管理员
    写于 最后由 编辑
    #2

    mpirun -np 2 redistributePar -reconstruct -parallel

    试试这个

    http://dyfluid.com/index.html
    需要帮助debug算例的看这个 https://cfd-china.com/topic/8018

    S 1 条回复 最后回复
  • S 离线
    S 离线
    Stan同学
    在 中回复了 李东岳 最后由 编辑
    #3

    @东岳 东岳老师,昨天我试了一下 好像是不行

    终端显示如下:

    FOAM FATAL ERROR:
    Invalid option: -reconstruct

    FOAM parallel run exiting

    MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1.

    1 条回复 最后回复
  • Z 离线
    Z 离线
    Zephyr
    写于 最后由 编辑
    #4

    用paraview的话是不用重构也可以直接后处理的

    S 1 条回复 最后回复
  • S 离线
    S 离线
    Stan同学
    在 中回复了 Zephyr 最后由 编辑
    #5

    @Zephyr 大佬 我一般只是用paraview来确定一下网格和各种场的设置是否无误 并且paraview后处理的话一般是绘图吧(用paraview用的比较少 不知道对不对:jingya: )

    但我这边是想要把计算的某些结果提出来(例如速度和压力) 应该还是要先重组一下的吧?

    Z 1 条回复 最后回复
  • Z 离线
    Z 离线
    Zephyr
    在 中回复了 Stan同学 最后由 编辑
    #6

    https://www.cfd-online.com/Forums/openfoam-post-processing/64652-bash-script-pseudo-parallel-usage-reconstructpar.html

    你一定要并行reconstructPar的话可以试一试这个

    S 2 条回复 最后回复
  • S 离线
    S 离线
    Samuel-Tu
    写于 最后由 编辑
    #7

    印象中以前看一个培训材料说分块和重构都只能单核

    S hurricane007H 2 条回复 最后回复
  • S 离线
    S 离线
    Stan同学
    在 中回复了 Zephyr 最后由 编辑
    #8

    @Zephyr 谢谢!我再用这个尝试一下

    1 条回复 最后回复
  • S 离线
    S 离线
    Stan同学
    在 中回复了 Samuel-Tu 最后由 编辑
    #9

    @Samuel-Tu 前些天邮件咨询了一下Jozsef Nagy教授 他的回复也是说重构只能单核

    1 条回复 最后回复
  • 李东岳李 离线
    李东岳李 离线
    李东岳 管理员
    写于 最后由 编辑
    #10

    https://www.openfoam.com/releases/openfoam-v3.0+/parallel.php

    你看看这个并测试一下,感谢反馈

    http://dyfluid.com/index.html
    需要帮助debug算例的看这个 https://cfd-china.com/topic/8018

    S 1 条回复 最后回复
  • Z 离线
    Z 离线
    Zephyr
    写于 最后由 编辑
    #11

    reconstructPar的速度真的挺迷的,也不知道到底怎么实现出来的,慢的离谱

    1 条回复 最后回复
  • hurricane007H 离线
    hurricane007H 离线
    hurricane007
    在 中回复了 Samuel-Tu 最后由 编辑
    #12

    @Samuel-Tu 我记得我也仔细研究过,重构的确是只能单线程。。。

    1 条回复 最后回复
  • S 离线
    S 离线
    Stan同学
    在 中回复了 李东岳 最后由 编辑
    #13

    @东岳
    东岳老师您好,我用一个tutorial中的小案例测试了一下,如果用mpirun -np 2 redistributePar -parallel,则在进行并行计算时会报错,报错内容是找不到processor中的初始文件p_rgh。

    如果并行计算前不用mpirun -np 2 redistributePar -parallel的话,照常decomposePar然后并行计算,最后用mpirun -np 2 redistributePar -reconstruct -parallel还是会报错,报错内容依然是Invalid option: -reconstruct。

    1 条回复 最后回复
  • S 离线
    S 离线
    Stan同学
    在 中回复了 Zephyr 最后由 编辑
    #14

    @Zephyr
    刚刚试了一下,确实感觉速度变快了:xinxin:

    1 条回复 最后回复
  • strive_DUTS 离线
    strive_DUTS 离线
    strive_DUT
    写于 最后由 编辑
    #15

    @李东岳 李老师,您知道Zephyr同学分享的这个脚本如何使用吗?:chigua:
    链接文本

    Z 1 条回复 最后回复
  • Z 离线
    Z 离线
    ZY_Feng
    在 中回复了 strive_DUT 最后由 ZY_Feng 编辑
    #16

    @strive_DUT 就是执行脚本,第一个参数输入核心数,可以看我写的知乎文章。https://zhuanlan.zhihu.com/p/636421703

    1 条回复 最后回复
  • 李东岳李 离线
    李东岳李 离线
    李东岳 管理员
    写于 最后由 编辑
    #17

    openfoam的decomposePar、reconstructPar是个老大难。这个应该需要大幅度的fund他们才会解决。目前他们对这方面还没有迫切的处理需求。目前openfoam针对reconstructPar这面的处理方式是后处理也是并行来搞,paraview直接看decompose的数据,各种postProcess也都是并行来。针对decomposePar慢的问题,openfoam这面是画网格snappyHexMesh直接并行来。所以我这面尝试处理2个亿网格,从生成到计算,也还可以。

    但是如果是第三方生成的2个亿网格,需要decomposePar,那可就慢了。

    http://dyfluid.com/index.html
    需要帮助debug算例的看这个 https://cfd-china.com/topic/8018

    1 条回复 最后回复
  • T 离线
    T 离线
    Tens 神
    写于 最后由 编辑
    #18

    感觉OpenFOAM的并行计算真的不太友好,decomposePar和reconstructPar速度慢是一方面,并行还会成倍的增加文件数量,经常因为小文件过多被管理员警告:135:

    李东岳李 1 条回复 最后回复
  • 李东岳李 离线
    李东岳李 离线
    李东岳 管理员
    在 中回复了 Tens 最后由 编辑
    #19

    @Tens 商软那面是怎么处理的。我看商软好像就是一个大文件。我没用过商软就难以理解咋回事。难道是打包压缩了么。。

    http://dyfluid.com/index.html
    需要帮助debug算例的看这个 https://cfd-china.com/topic/8018

    T C 2 条回复 最后回复
  • T 离线
    T 离线
    Tens 神
    在 中回复了 李东岳 最后由 编辑
    #20

    @李东岳 是一个大文件,不过这样又不好对数据后处理。OF这面如果不需要decomposePar成processor和reconstructPar,并行和单核一样计算就挺好的

    1 条回复 最后回复

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